Refugio de un patrimonio cultural que comprende más de 10 mil años de historia, el Museo Arqueológico San Miguel de Azapa es otro de los principales atractivos arqueológicos de la región.
Ubicado a un poco más de 10 kilómetros del Valle de Azapa, cuenta con vestigios antropológicos y con alrededores de pintoresca flora y fauna nativa. Privilegiado con favorables condiciones climáticas, en sus afueras es posible encontrar petroglifos mientras que en el interior destaca una muestra cronológica que abarca desde el periodo de los pescadores y cazadores anteriores al periodo de las momias de Chinchorro hasta los pastores aymaras, las cuales pueden ser fotografiadas con previa autorización del museo. La exhibición comprende más de 20 mil piezas que grafican el desarrollo de las poblaciones divididas en tres secciones que comprenden temáticas acerca de la tierra y el mar, los hombres y la producción agrícola y artesanal, y el mundo mágico y religioso.
El Museo Arqueológico de San Miguel de Azapa es famoso por sus colecciones de petroglifos y momias de Chinchorro, las cuales son reconocidas a nivel mundial, por ser las más antiguas del mundo. Lo que las convierten y por consiguiente al mismo museo en uno de los sitios casi obligados a la hora de visitar la XV región de Arica y Parinacota.